发布机构:

芬兰分子医学研究所

发布日期:

2024-11-21

简要介绍:

导言

绘制药物化合物及其分子靶点之间的相互作用是药物发现和重新使用的一个基本方面。药物目标的相互作用对于阐明作用机制和优化药物的功效和安全性具有重要意义。为了系统地预测药物目标的相互作用,已经开发了几种计算方法。然而,药物目标预测的计算和实验验证在各个研究中差异很大。

涵盖的领域

通过一个BoubMed查询,涵盖了一个包含3,286篇关于过去十年中发表的药物目标相互作用预测文章的文集。在3,286篇文章中,自然语言处理被用于自动化抽象分类,以研究计算方法、验证策略和绩效评估指标的演变。此外,对259项对计算预测进行实验验证的研究进行的人工分析表明,普遍存在的实验协议。

专家意见

自2014年起,侧重于药物目标相互作用预测的文章显著增加。对接回归是计算方法中最常用的技术,交叉验证是计算验证的常用策略。建议使用多个正交验证策略测试预测,并应报告具体的目标预测应用。实验验证仍然相对较少,应更经常地进行,以评估预测的生物相关性。

药物目标预测方法验证指南.pdf